Equipe CIMEs

Ingénierie moléculaire de la catalyse et des enzymes

Catalyse et Ingénierie Moléculaire Enzymatiques

Les recherches de l’équipe CIMEs sont axées sur des études approfondies de la mécanisation et des relations structure-activité d’un large éventail d’enzymes. Elle couvre également les développements stratégiques dans la découverte d’enzymes, l’évolution dirigée, l’ingénierie (semi-)rationnelle et la conception computationnelle de protéines.

En développant les connaissances fondamentales de la fonction enzymatique, et en partageant l’expertise du personnel et les installations expérimentales en donnant la priorité aux approches intégratives et multidisciplinaires, l’objectif est de fournir des catalyseurs naturellement puissants ou optimisés sur mesure pour la biotechnologie industrielle et la biologie synthétique.

L’équipe se concentre sur quatre champs thématiques :

  • La découverte d’enzymes, l’exploration de données, la génomique fonctionnelle et la métagénomique fonctionnelle
  • L’étude, la conception et l’ingénierie de la structure-fonction des enzymes
  • La compréhension de la coopération et de l’interaction entre les enzymes qui doivent agir ensemble pour dégrader ou synthétiser des molécules complexes
  • L’étude d’enzymes cibles.

Domaines d'application

Apporter les avantages des processus catalysés par des enzymes au développement de produits destinés aux secteurs de l'alimentation humaine et animale, de la santé, de la chimie, de l'énergie ou de l'environnement.

Valorisation des matières premières agro-alimentaires en produits à valeur ajoutée

Intégration d'enzymes nouvellement découvertes ou modifiées dans :

Modélisation & Design Moléculaires
MetaOmiques pour la Découverte de Fonctions Microbiennes
Enzynov
Enzymes pour les Carbohydrates

Les thèmes de l'équipe

L’équipe du CIMEs est organisée en 5 groupes thématiques et bénéficie du soutien technique de l’installation de criblage à haut débit PICT-ICEO.

Académique :

TIMC-IMAG (Grenoble), DSIMB (Univ. Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité), MIAT-INRAE (Toulouse), LAAS-CNRS (Toulouse), BIA-INRAE (Nantes), MICALIS-INRAE (Jouy-en-Josas), IPREM (Pau), AFMB (Marseille),University of Cambridge (UK)

Industriel :

Resicare by Michelin, Carbios, Servier, Roquette, Solvay, Pili, Sweetech, Adisseo

  • Maxime Artico – (TBI – IMRCP)- ELASTIC – Modulation de l’activité d’enzymes hémicellulolytiques à l’aide de surfaces élastiques à géométrie contrôlable pour la valorisation de la biomasse végétale
  • Elodie Bascans – (TBI – IPREM) – New biomaterials and glycosylation of marine compounds
  • Sarah Blosse – (TBI – IMFT) – TOPAZ – Suivi in-situ par TOmographie X sur PAille de blé brute des mécanismes de dégradation enZymatique de la biomasse végétale : une approche combinant génie enzymatique et physique des milieux poreux
  • Younes Bouchiba – (TBI – LAAS-CNRS) – Computational design of proteins taking into account molecular flexibility: approach combining molecular modelling and artificial intelligence
  • Marianne Defresne – (TBI – MIAT-INRAE) – Computational protein design with automated reasoning and deep learning
  • Ahmed Khamassi – (TBI – IPBS)- DECO – Caractérisation Structure-Fonction et Co-ingénierie d’enzymes impliquées dans la dégradation de la biomasse Lignocellulosique.
  • Thibaud Laffargue –(TBI) – Enzymatic routes for polysaccharide functionalization
  • Romain Launay – (TBI) – Caractérisation et compréhension fonctionnelle d’assemblages enzymatiques
  • Awilda Maccow – (Pili – TBI) – Chemo-enzymatic pathways for dyeing cellulosic materials
  • Maike Pertermann – (CIMES – TIM) – Transport and diffusion of lignocellulolytic enzymes in their polymeric substrate
  • Agata Raczynska – (TBI – Silesian University of Technology, Pologne) – Biodegradation of synthetic polymers with the use of enzymes
  • Xiaoqian LI (TBI) – Engineering of oligosaccharide transporters
  • Maxant Vivier (TBI-SweeTech) – Synthèse in cellulo d’oligosaccharides pour la santé humaine

European: EvoXUL (MSCA)

European : RadicalZ (2021-2025)- RIA

ANR DECO (2019-2023)

ANR CONCERTO (2022 – 2026)

ANR Deepen (2020-2024)

ANR Grafting (2019-2022)

ANR Cazibd (2021-2025)

ANR Mobidyc (2022-2026)

ADEME Bioimpulse (2019-2025)

3BCAR NeoZYm, SOURCE

Projet prématuration INRAE Plateforme logicielle (2022)