Equipe BLADE

Adaptation, diversité et ingénierie bactérienne

Une équipe experte de

La physiologie bactérienne

Les activités de recherche de l’équipe BLADE s’inscrivent dans le domaine de la physiologie bactérienne et visent à mieux comprendre les mécanismes d’adaptation des bactéries à leur environnement pour mieux maitriser leur utilisation. L’équipe a pour objectif 1) d’acquérir des connaissances fondamentales et mécanistiques sur le fonctionnement des bactéries et 2) d’accroitre leurs performances en biotechnologie par des stratégies d’ingénierie répondant aux enjeux de la bioéconomie. L’équipe s’intéresse particulièrement à deux bactéries modèles, Lactococcus lactis et Escherichia coli, dont les domaines d’application sont l’industrie agro-alimentaire, la santé humaine et la biotechnologie blanche.

Au laboratoire, les bactéries sont étudiées en les soumettant à des perturbations génétiques (mutants) ou environnementales (stress, changement de source de carbone, épuisement en nutriment, etc.), seules ou en interaction avec d’autres bactéries ou des sous-populations hétérogènes. L’équipe utilise les approches et méthodologies de la biologie des systèmes qui consistent à caractériser par des outils « omiques » les différents niveaux des processus cellulaires (gènes, ARNm, protéines et métabolites), puis les intégrer par des modèles mathématiques afin d’acquérir une vision systémique et hiérarchisée de l’ensemble des régulations mises en jeux.

Les thèmes de l'équipe

  • ANR
  • TWB
  • Région Occitanie
  • TTT
  • 3Bcar 
  • Lesaffre
  • Pedro Gomes. Exploration du potentiel santé de souches de Lactococcus lactis dans le dialogue bidirectionnel avec l’hôte. Direction H. Eutamene [Toxalim] et M. Cocaign-Bousquet [TBI]
  • Fan Chen. Rôle de séquences régulatrices dans la régulation de l’expression génique chez Escherichia coli. Direction L. Girbal [TBI] et S. Nouaille [TBI]
  • Charlotte Roux. Rôle de la polyadénylation des ARN dans la régulation du métabolisme de Escherichia coli. Direction L. Girbal [TBI] et E. Hajnsdorf [IBPC]

Thèses soutenues depuis 2019 

  • Kevin Debatisse. Reprogrammation de la spécificité de recombinaison d’une intégrase phagique. Direction P. Le Bourgeois [TBI]  
  • Manon Barthe. L’hétérogénéité métabolique dans la capacité adaptative de la bactérie Escherichia coli. Direction M. Cocaign-Bousquet [TBI] et B. Enjalbert [TBI] 
  • Marie-Aurore Caillaud. Dynamique, stabilité et robustesse d’un ferment autochtone. Direction M.L. Daveran-Mingot [TBI] et H. Tormo [EI Purpan] 
  • Etienne T. Analyse intégrative de la coordination entre stabilité des ARNm et physiologie cellulaire chez Escherichia coli. Direction D. Ropers [INRIA] et M. Cocaign-Bousquet [TBI]. 
  • Nguyen H. Régulation de la traduction des ARNm chez Escherichia coli. Direction M. Cocaign-Bousquet [TBI] et L. Girbal [TBI]. 
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