Equipe PEEP
Ingénierie et Evolution des Voies Métaboliques chez les Procaryotes
Ingénierie et Evolution des Voies Métaboliques chez les Procaryotes
Créée en 1995, l’équipe « Ingénierie et Evolution des Voies Métaboliques chez les Procaryotes » dédie ses travaux de recherche fondamentale i) à l’analyse exhaustive du métabolisme central bactérien afin d’en améliorer la connaissance et d’en identifier les mécanismes de régulation et ii) à l’évolution adaptative des bactéries sous contraintes métaboliques. Sur la base de la connaissance acquise sur les réseaux métaboliques, le concept d’usine cellulaire microbienne est développé : de nouvelles voies métaboliques sont créées et le métabolisme est rationnellement modifié et réorienté, afin de maximiser le rendement de conversion substrat/produit pour la production biologique de synthons pour la chimie et/ou l’énergie. L’objectif plus appliqué des travaux de recherche est le développement de procédés biotechnologiques innovants et originaux, utilisant les nouvelles usines cellulaires générées, pour convertir des ressources renouvelables peu couteuses et respectueuses de l’environnement en produits de base d’intérêt pour la chimie et/ou pour l’énergie. Ces travaux s’inscrivent donc dans le concept des biotechnologies blanches, et celui plus général de la bioéconomie.
Responsable de l'équipe
Isabelle MEYNIAL-SALLES
Les thèmes de l'équipe
L’ensemble des travaux menés par l’équipe d’Ingénierie et d’Evolution des Voies Métaboliques chez les Procaryotes est réalisé dans le cadre de projets collaboratifs avec des partenaires i) académiques (Français, Européens, Internationaux) ou ii) industriels :
- Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, BIP Marseille
- Laboratoire de Chimie Bactérienne, Marseille
- INRAE
- TWB, Toulouse
- LBE Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement, Narbonne
- University of Nottingham (UK)
- Ulm University (Germany)
- Goethe University of Frankfurt (Germany)
- Technical University of Munich (Germany)
- University of Girona (Spain)
- Korean Advanced Institute of Science and Technology (Korea)
- Rice University Houston (USA)
- METabolic EXplorer
- 3BCarb
- Sanofi Vaccins
- Welchem Lamotte
- B2IP-H2 (2023-2026)
- BIOMETCHEM (2018-2022)
- EcoChem (2018-2022)
- Electro-Biopower (2018-2022)
- FNOR (2014-2023)
- Hyd Bif evo (2023)
- Hydrogénase (2013-2023)
- NoCarbonLost (2023-2024)
- Syn4Ols (2020-2022)
- SynConsor4Butanol (2020-2023)
- TeTax (2017-2026)
- SYNBIOCHEM (2019-2023)
2020-2023 Eglantine Boudignon : Conception d’un consortium synthétique stable pour la conversion de cellulose en n-butanol soutenance prévue fin 2023 Ecole doctorale SEVAB.
2019- 2024 Paul Jacottin : Ingénierie métabolique de Clostridium acetobutylicum pour la production d’acides aminés soutenance prévue fin 2022 Ecole doctorale SEVAB
Thèses soutenues :
2019-2022 Quentin Ramette : Construction de souches cellulolytiques de Clostridium acetobutylicum pour la production de produits chimiques de commodités soutenance prévue fin 2022 Ecole doctorale SEVAB.
2018-2022 Guillaume Prégnon : Caractérisation du métabolisme de Eubacterium limosum par une approche quantitative de biologie des systèmes, soutenance prévue courant 2022 Ecole doctorale SEVAB
2018-2022 Caroline Rousseau : Ingénierie rationnelle du métabolisme central d’Escherichia coli pour la production d’un produit chimique d’intérêt industriel, soutenue le 8 Février 2022 Ecole doctorale SEVAB.