Cellule mathématiques

Un cellule dédiée à la

Modélisation mathématique

La Cellule Mathématiques de TBI, se concentre sur la modélisation mathématique des systèmes biochimiques et microbiens.

Sergueï SOKOL

Responsable de la cellule

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Expertises

Modélisation mathématiques des systèmes biochimiques et microbiennes (métabolisme bactérien, croissance microbienne, cocktails enzymatiques, simulation de marquage isotopique pour estimer des flux métaboliques (13C-fluxomique)

Estimation de paramètres

Offres / technologies / outils

  • Traduction de modèles biologiques en modèles/logiciels mathématiques
  • (Co-)développements de logiciels scientifiques (R, Python, C++, …)
  • (Co-)rédaction d’articles avec une composante mathématiques

Equipe METASYS (TBI), Equipe SYMBIOSE (TBI),  METATOUL, Metabohub, Université de Pennsylvanie…

G3MClass : classification avancée de biomarqueurs

DynaFluxR : de mesures cinétiques de métabolites vers des vitesses de réactions sans modèle de régulation

Influx2020 : nouveaux formats, nouvelle ergonomie, nouvelles capacités dans la fluxomique par marquage.