PEEP team

Engineering and Evolution of Metabolic Pathways in Prokaryotes

Engineering and Evolution of Metabolic Pathways in Prokaryotes

Created in 1995, the team "Engineering and Evolution of Metabolic Pathways in Prokaryotes" dedicates its fundamental research to i) the exhaustive analysis of bacterial central metabolism in order to improve our knowledge and to identify its regulation mechanisms and ii) the adaptive evolution of bacteria under metabolic constraints. Based on the knowledge acquired on metabolic networks, the concept of microbial cellular factory is developed: new metabolic pathways are created and metabolism is rationally modified and reoriented, in order to maximize the substrate/product conversion yield for the biological production of synthons for chemistry and/or energy. The more applied objective of the research work is the development of innovative and original biotechnological processes, using the newly generated cell factories, to convert inexpensive and environmentally friendly renewable resources into feedstocks of interest for chemistry and/or energy. This work is therefore part of the concept of white biotechnologies, and the more general concept of the bioeconomy.

The team's topics

L’ensemble des travaux menés par l’équipe d’Ingénierie et d’Evolution des Voies Métaboliques chez les Procaryotes est réalisé dans le cadre de projets collaboratifs avec des partenaires i) académiques (Français, Européens, Internationaux) ou ii) industriels :

  • Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, BIP Marseille
  • Laboratoire de Chimie Bactérienne, Marseille
  • INRAE
  • TWB, Toulouse
  • LBE Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement, Narbonne
  • University of Nottingham (UK)
  • Ulm University (Germany)
  • Goethe University of Frankfurt (Germany)
  • Technical University of Munich (Germany)
  • University of Girona (Spain)
  • Korean Advanced Institute of Science and Technology (Korea)
  • Rice University Houston (USA)
  • METabolic EXplorer
  • Sanofi Vaccins
  • Welchem Lamotte
  • BIOMETCHEM (2018-2022)
  • EcoChem (2018-2022)
  • Electro-Biopower (2018-2022)
  • FNOR (2014-2022)
  • Hydrogénase (2013-2023)
  • Syn4Ols (2020-2022)
  • SynConsor4Butanol (2020-2023)
  • TeTax (2017-2025)
  • SYNBIOCHEM (2019-2023)
  • 2020-2023 Eglantine Boudignon : Conception d’un consortium synthétique stable pour la conversion de cellulose en n-butanol soutenance prévue fin 2023 Ecole doctorale SEVAB.

  • 2019- 2022 Paul Jacottin : Ingénierie métabolique de Clostridium acetobutylicum pour la production d’acides aminés soutenance prévue fin 2022 Ecole doctorale SEVAB

  • 2019-2022 Quentin Ramette : Construction de souches cellulolytiques de Clostridium acetobutylicum pour la production de produits chimiques de commodités soutenance prévue fin 2022 Ecole doctorale SEVAB.

  • 2018-2022 Guillaume Prégnon : Caractérisation du métabolisme de Eubacterium limosum par une approche quantitative de biologie des systèmes, soutenance prévue courant 2022 Ecole doctorale SEVAB

  • 2018-2022 Caroline Rousseau : Ingénierie rationnelle du métabolisme central d’Escherichia coli pour la production d’un produit chimique d’intérêt industriel, soutenue le 8 Février 2022 Ecole doctorale SEVAB.