Thème "EnzyOne"
Enzymes et assemblages moléculaires pour la santé de tous
Quelques mots sur le thème
Enzymes et assemblages moléculaires pour la santé de tous
L’objectif de cet axe est d’étudier et développer des solutions biotechnologiques dédiées à la santé humaine, l’alimentation et au bien-être tout en préservant l’environnement selon l’approche de « Santé Globale » qui reconnait l’interconnexion et l’interdépendance de ces différents sujets. Nos modèles d’études sont variés, avec une grande diversité de fonctions enzymatiques principalement impliquées dans des réactions de synthèse ou de modification de molécules. Un axe fort de recherche concerne la synthèse à façon et contrôlée d’oligosaccharides, de polysaccharides et de glycoconjugués à l’aide de transglycosylases et de glycoside-phosphorylases bactériennes, qu’elles soient naturelles et/ou évoluées. Le second axe majeur concerne le développement et la mise en œuvre de méthodes et d’outils associant modélisation moléculaire et intelligence artificielle dédiés à l’étude des relations structure-dynamique-fonction et au design de protéines pour de nouvelles approches d’ingénierie sur mesure d’enzymes, de nano-anticorps, de « binders » et d’assemblages multiprotéiques ou protéines-polysaccharides.
Responsables du thème : Claire Moulis & Sophie Barbe
Les projets
Projet RADICALZ
2021-2025
FNR16 -2020
Rapid discovery and development of enzymes for novel and greener consumer products
Développement d’outils de criblage d’enzymes actives sur les sucres à très haut débit par des nouvelles approches de microfluidique pour la synthèse de nouvelles molécules nutraceutiques.
Projet GRAFTING
2019-2023
ANR CE43 PR
Green Routes for the Functionalization of alpha-Glucans
Développement de voies enzymatiques pour la fonctionnalisation in vitro de polysaccharides tels que les alpha-glucanes afin de générer de nouveaux biopolymères chargés. Les applications visées concernent le secteur des biomatériaux et de la santé humaine.
SMALA
2022-2026
ANR CE07 PRC
From small to macrolactams: an enzymatic approach
Découverte et ingénierie (rationnelle et aléatoire) d’enzymes pour la synthèse in vitro de lactames de diverses tailles (importants ingrédients actifs pharmaceutiques et plateformes chimiques de divers types de polymères).
Sweetech
2022-2025
Thèse CIFRE
In cellulo synthesis of oligosaccharides for human health, in collaboration with Sweetech
Caractérisation de nouvelles enzymes et ingénierie d’E. coli pour la synthèse in cellulo d’oligosaccharides bioactifs d’intérêt pour la santé humaine et la cosmétique.
Thèse Nina Cooper
2022-2025
Dynamics of enzymes dedicated for the synthesis or functionalization of biopolymers
Etude de la dynamique structurale d’enzymes multi-modulaires de grande taille (>150 kDa) par des approches intégratives de biologie structurale.
NeoZYM
2021-2023
3BCar
Extending the catalytic promiscuity of artificial and natural metalloCAZymes to create unnatural reactivity
Le projet NeoZYM a pour double objectif de créer des métalloenzymes artificielles par incorporation d’acide aminé non-canonique afin de leur conférer de nouvelles propriétés catalytiques et d’étendre la promiscuité catalytique de métalloenzymes naturelles.
Thèse Marianne Defresne
2020-2023
Computational Protein Design with Automated Reasoning and Deep Learning
Développement de nouvelles méthodes de design de protéines associant deux domaines de l’intelligence artificielle, le raisonnement automatique et l’apprentissage profond
Thèse Younes Bouchiba
2019-2023
Considering flexibility in protein design by combining molecular modelling & artificial intelligence
Prise en compte de la flexibilité moléculaire dans le design de protéines via de nouvelles méthodologies combinant modélisation moléculaire et intelligence artificielle : application à la conception de différents types de protéines.
ANDES
2023-2026
ANR CE45
Artificial-intelligence-based methods for nanobody design
Développement et validation de méthodes basées sur des algorithmes d’intelligence artificielle pour le design computationnel de nanobodies d’intérêt pour des applications thérapeutiques ou du diagnostic.