Equipe PHYGE

Physiologie intégrée et génomique fonctionnelle des systèmes microbiens

Comprendre la physiologie des microorganismes

L’activité de recherche de l’équipe PHYGE vise à comprendre la physiologie des microorganismes sous contraintes environnementales de manière “intégrative”, en combinant les approches et outils de la physiologie quantitative (méthodes biochimiques, moléculaires et biophysiques) avec celles du génie microbiologique (conduite de réacteur, stratégie nutritionnelle) pour une caractérisation phénotypique des microorganismes au plus près de la réalité industrielle.

Deux axes majeurs sont abordés :

  • L’axe I « Understanding and engineering microbial cells for functional food, feed and health » concerne la compréhension de la physiologie et des interactions microbiennes pour les aliments fonctionnels et la biotechnologie industrielle.
  • L’axe II « Understanding cell heterogeneity for mastering robustness in bioproduction » concerne la compréhension de l’hétérogénéité cellulaire pour maîtriser la robustesse des souches microbiennes en condition de bioproduction intensive.

Dans l’ensemble, les activités de recherche visent à acquérir des connaissances scientifiques qui seront mis au service de projets plus applicatifs en biotechnologie industrielle ou en santé humaine ou animale.

Les thèmes de l'équipe

  • Local : Pôles de TBI (PRISM ; Biocatalyse ; Génie des Procédés Durables ; Technologique) ; CRITT-BioIndustries ; Toulouse White Biotechnology
  • Régional : CNES-CADMOS ; CRT-CATAR ; ICA-UMR CNRS 5312 ; Toxalim-UMR 1331 ; UCAI-UMR 1010 ; UMR SPO Montpellier 
  • National : ESPCI ; Institut Curie ; LCPO ; PNCA-UMR 914 ; PSAE-UMR 0210 ; SayFood-UMR 0782 ; IECB Bordeaux
  • International: A*Star (Singapore) ; ACIB (Austria) ; Indian Institute of Science Bangalore ; NUS (Singapore) ; RWTH Aachen (Germany) ; TU Berlin (Germany) ; TU Graz (Austria) ; Universidade Nova de Lisboa (Portugal) ; University of Groningen (Netherland) ; Technische Universität Dresden Institut für Naturstofftechnik ; Technology and Innovation of KOBE University ; University of Liège-Gembloux Agro-Bio Tech Collaborations Industrielles : baCta Life ; (Erbi-BIO) Merck KGaA ; ESSI Tech ; EUROSAFE ; Lallemand Nutrition Animale
  • Albane, Astier – Study of the dynamics of physiological states of cerevisiae under carotenoid production conditions controlled by optogenetics and assisted by online flow cytometry.
  • Antoine, Boy – Étude des facteurs impactant la robustesse de souches génétiquement modifiées de Cupriavidus necator pour la production d’hydrocarbures en bioréacteur à partir de CO2.
  • Alejandro, Ordonnez – Étude de la transition dimorphique de Yarrowia lipolytica dans des conditions de production de lipides : analyse quantitative de la distribution de sous-populations avec différents morphotypes et capacités d’accumulation.
  • µO-PROT
  • Collimator
  • OptisFuel
  • AstroPOU
  • ConCO2rde
  • PolyMorphoil
  • Lallwall

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