Thème "Variabilité biologique et adaptation cellulaire"
Quelques mots sur le thème
Variabilités génétique, épigénétique et expression des gènes
Les variabilités génétique, épigénétique et d’expression des gènes (aussi appelée bruit d’expression) sont généralement considérées indépendamment dans leur relation avec la variation phénotypique. Cependant, ces trois types de variabilité semblent être intrinsèquement interconnectées. Ainsi, nous nous demandons si ces trois sources de variabilité biologique s’influencent mutuellement, et si leur interaction module la variabilité phénotypique et l’adaptation cellulaire chez la levure Saccharomyces cerevisiae. Par des approches à l’échelle de la cellule unique, nous nous intéressons à divers phénomènes génomiques et épigénomiques (taux de recombinaison homologue et stabilité des transgènes, silençage épigénétique…) et à divers traits phénotypiques liés à des problématiques biotechnologiques, tels que la résistance au stress, le taux de croissance unicellulaire, le vieillissement cellulaire…
Les projets
Projet NoHighRec
Projet précompétitif “NoHighRec” à Toulouse White Biotechnology (TWB) d’octobre 2020 à septembre 2022. Titre complet : Vers une élimination continue des cellules à forte recombinaison pour stabiliser les souches industrielles. Dans la lignée de nos précédents résultats caractérisant l’hétérogénéité de cellule à cellule du taux de recombinaison homologue chez S. cerevisiae (Liu et al, Front Genet, 2019), ce projet vise à (1) caractériser l’instabilité génétique des cellules à haute recombinaison (“high-rec”) par rapport aux ” low-rec “, notamment au niveau des transgènes conférant des caractéristiques de production, et (2) développer un réseau de gènes synthétiques capable d’éliminer en continu les cellules high-rec pour éviter la perte de production par cette source d’instabilité génétique.