Thème "SysCarb"
Microbial Enzymes and Nano-Assemblies for Polysaccharide Utilization
Quelques mots sur le thème
Enzymes microbiennes et nano-assemblages pour l'utilisation des polysaccharides
Les glucides sont omniprésents dans la Nature et sont essentiels à toutes les formes de vie. De structures très diverses et complexes, ils jouent un rôle essentiel pour notre santé, notre alimentation et sont une ressource importante pour le développement des énergies renouvelables ou les biomatériaux.
Dans l’axe Sys-Carb, nous travaillons à la compréhension des systèmes protéiques produits par les microorganismes pour utiliser les polysaccharides. Ceci implique l’étude des éléments clés de ces voies métaboliques, à savoir les enzymes, les systèmes multi-protéiques et les transporteurs.
Nous nous intéressons notamment à comprendre :
- Quels sont les microorganismes et les enzymes importants dans un écosystème pour la dégradation des oligo- et polysaccharides ?
- Quels sont les déterminants moléculaires des interactions protéines-glucides ?
- Quels sont les facteurs qui influencent les synergies enzymatiques ?
- Comment les enzymes fonctionnent-elles in planta ?
- Comment les modifications post-traductionnelles, telle que la glycosylation des protéines, contribuent-elles à la reconnaissance et à l’hydrolyse des polysaccharides ?
Responsable du thème : Claire Dumon
Les projets
Projet Bluetools
2023-2027
Bluetools Horizon CL6-2022-CIRBIO
Innovative tools for sustainable exploration of marine microbiomes: towards a circular blue bioeconomy and healthier marine environments
In BLUETOOLS, we explore marine microbiomes for novel enzymes involved in the breakdown of microbial, algal and marine plant polysaccharides. These innovative biocatalysts will be used for the production of oligosaccharides of interest for human health.
CONCERTO
2022-2025
ANR-21-CE43-0024
Controlled spatial prOximity for iNnovating enzymatic Cascades to Enhance biomass deconstRucTiOn
Les enzymes jouent un rôle crucial dans le métabolisme cellulaire. Elles peuvent agir soit individuellement, soit au sein d’organisations complexes ayant des activités catalytiques distinctes. L’hydrolyse complète de la paroi cellulaire végétale nécessite un large éventail d’activités enzymatiques différentes travaillant en synergie sous la forme d’un cocktail d’enzymes libres ou immobilisées sur un complexe multiprotéique lié à la membrane cellulaire externe. Dans cette configuration, on pense que la proximité spatiale et l’orientation du site catalytique sont d’une importance capitale dans l’efficacité particulière du cellulosome dans la dégradation de la biomasse végétale. Concerto a pour objectif d’étudier l’effet de proximité spatiale d’un tel complexe multienzymatique au moyen d’une approche d’ingénierie originale combinant étude enzymatique, structure du complexe en solution et analyse systématique du profil de produit libéré par le complexe. Le projet vise à améliorer notre compréhension de la synergie entre enzymes afin de produire des produits sur mesure à partir de la biomasse complexe.
LABEL
2023-2026
ANR-22-CE43-0012
Conception d’assemblages moléculaires pour évaluer le rôle de la glycosylation sur l’activité d’hémicellulases
Le rôle de la glycosylation des glycoside hydrolases n’est pas bien élucidé, notamment en ce qui concerne les interactions enzyme-substrat et l’effet sur leur activité hydrolytique. En utilisant l’incorporation site-spécifique d’acides aminés non-canoniques et la chimie bioorthogonale, des hémicellulases fluorescentes glycosylées sont préparées et étudiées, notamment en termes d’interactions avec le substrat. Leur potentiel catalytique et de diffusion est évalué au sein de matrices complexes polysaccharidiques mimant la paroi végétale.
BIO4
2021-2024
Ademe
Développement d’un démonstrateur valorisant l’hémicellulose du bois
Le projet BIO4 « Vers une Bioraffinerie de bois InnOvante » a pour ambition de mettre au point un procédé d’extraction et de valorisation des hémicelluloses du bois.
OPTI-ZYME
2023-2027
Ademe
Procédé de biorecyclage des déchets PET de seconde génération aux performances économiques et environnementales optimisées