Présentation du plateau MetaToul - Réseaux Métaboliques
METATOUL - RESEAUX METABOLIQUES : ANALYSE FONCTIONNELLE DES RESEAUX METABOLIQUES
TBI abrite le plateau Réseaux Métaboliques de la plateforme MetaToul. Ce plateau est spécialisé dans l'analyse fonctionnelle des réseaux métaboliques et conçoit, développe, valide et met à disposition des approches telles que :
- Développement et applications de méthodes RMN et SM complémentaires pour l’analyse des réseaux métaboliques
- Métabolomique quantitative
- Identification de voies métaboliques par marquage isotopique (13C-métabolomique)
- Mesure des flux métaboliques (13C-Fluxomique)
- Modélisation des systèmes métaboliques (calcul des flux, etc.).
Co-responsables de plateau : Lindsay PEYRIGA et Floriant BELLVERT
Tel : 05 61 55 93 55, 05 61 55 94 07
Equipements du plateau MetaToul - Réseaux Métaboliques :
Résonance Magnétique Nucléaire
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Spectromètre Bruker Avance 800 MHz : cryosonde 5 mm ATMA QPCI 1H-13C-31P-15N gradient z, microcryosonde 1.7 mm ATMA "QTCI" 1H-13C-31P gradient z, Sonde chaude BBI 3mm gradient z, passeur d'échantillons réfrigéré SampleJet |
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Spectromètre Bruker Avance 500 MHz : sonde BBI H-BB-D Z-Grd 5mm (BTO), sonde TXI S2 H-P/C Z-Grd 5mm ATMA (BTO), sonde BBO SB BB-H-D 10mm (BVT), sonde BBI S2 H-BB-D 8mm (BVT), TXO SB P/C-H 15mm (BTO), LC-RMN SEI 3mm gradient Z ATMA (BTO), passeur d'échantillons réfrigéré Sample Jet |
Spectrométrie de masse
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Spectromètre de masse Orbitrap Q-Exactive (Thermo) : source d'ionisation par ESI, Chaîne U-HPLC Vanquish ou Chaîne ISC-5000+ |
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Spectromètre de masse Q-Tof Xevo G2-XS (Waters) : équipé d’une source ESI, Chaîne U-HPLC Acquity I-Class |
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Spectromètre de masse LTQ-OrbiTrap Velos : équipé d’une source ESI, Chaîne U3000 ou u Chaîne ISC-5000+ |
Systèmes automatisés pour la métabolomique et la fluxomique
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Robot de culture automatisée pour la fluxomique Ce robot, conçu conjointement par le personnel de la plateforme, l'équipe MetaSys de TBI, et la société TECAN, permet de paralléliser la culture de microorganismes avec des substrats enrichis en 13C pour la fluxomique. Le robot permet la culture entièrement contrôlée de 48 bioréacteurs en parallèle ainsi que l'échantillonnage automatisé pour la métabolomique et la fluxomique. Il s'agit d'un dispositif unique au monde, réalisé à façon pour les besoins de la plateforme. |
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Robot "liquid handler" pour la préparation automatisé des échantillons
Ce robot permet la préparation automatisée des échantillons de spectrométrie de masse et de RMN. Il est compatible avec un grand nombre de consommables (plaque 96 puits, cryovials, falcon, tubes à hémolyse etc...) |