Dephine LABOURDETTEIngénieur d’Etudes en bioinformatique
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Delphine LABOURDETTE |
CV
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Depuis Octobre 2001 |
Ingénieur d’études - Plateforme GeT-Biopuces (Toulouse-31). Analyse d’image et exploitation des données de transcriptome d’études de Micro-Array ou de séquençage haut débit (RNA-seq). |
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Mars-Septembre 2001 |
Stage DESS Bioinformatique - Plateforme GeT-Biopuces (Toulouse-31). Analyse du transcriptome de la levure. |
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Février-Juin 2000 |
Stage DEA - Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (Toulouse-31). Conception et étude d'analogues d'antigènes tumoraux résistants à la protéolyse. |
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Septembre 1999 - Février 2000 |
Stage DEA - Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (Toulouse-31). Mise au point de l'interruption du gène de la nucléoline dans les cellules DT40. |
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Septembre-Octobre 1998 |
Stage de Maîtrise – Elf Exploration Production (Pau-64). Traitements statistiques et valorisation de données géochimiques |
Formation
2001 DESS de BioInformatique (Toulouse III, 31)
2000 DEA de Biologie-Santé-Biotechnologie (Toulouse III, 31)
1999 Maîtrise de Biochimie (UPPA, 64)
RESEARCH TOPICS
Microarray
- Conseiller / Former le client sur les analyses d’images
- Maitriser les logiciels d’analyse d’image associés aux lecteurs de puces
- Effectuer les analyses d’images de biopuces
- Effectuer les contrôles qualité nécessaire à l’obtention du produit conforme
NGS (Séquençage de nouvelles générations)
- Planifier / effectuer les analyses de séquences (nettoyage, mapping…) des données de séquençage transcriptomiques (RNAseq)
- Conseiller le client sur les analyses
- Effectuer les contrôles qualité nécessaire à l’obtention du produit conforme
TEACHING
Formation des utilisateurs aux technologies et appareils d’analyse d’image de la plateforme GeT-Biopuces.
Formation à l'analyse d'expression des gènes codant pour des protéines en utilisant des séquences de type RNA-Seq, en collaboration avec la plateforme BioInfo de toulouse.
PUBLICATIONS
Beltran G, Novo M, Leberre V, Sokol S, Labourdette D, Guillamon JM, Mas A, Francois J, Rozes N.
Integration of transcriptomic and metabolic analyses for understanding the global responses of low- temperature winemaking fermentations. FEMS Yeast Res. 2006 Dec;6(8):1167-83.
Lagorce A, Hauser NC, Labourdette D, Rodriguez C, Martin-Yken H, Arroyo J, Hoheisel JD, Francois J.
Genome-wide analysis of the response to cell wall mutations in the yeast Saccharomyces cerevisiae. J Biol Chem. 2003 May 30;278(22):20345-57.